3章
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初クエスト～ロボトル大会まで
クエスト『探索：倉庫地下施設』を選ぶとストーリーが進み、ロボトル大会終了まで他のクエストに挑戦不能になる。
選択しなかったクエストは後に受けられる。
- クエスト『探索』
- ロボトル大会
| 場所 | 入手パーツ・アイテム | 備考 |
|---|---|---|
| 港町 | かくとうアップEX ×3 | |
| ビーチ | サイドムーブ一式 | |
| 山道 | ウィールコーム一式 | |
| 霧の樹海 | ゼーゲホルン一式 (カブトVer.) ヒルシュケーファ一式 (クワガタVer.) | |
| 渓流 | インフィニティス一式 | |
| 水車小屋 | シャペロルージュ一式 (カブトVer.) リトルレイシー一式 (クワガタVer.) | |
| 滝の裏 | ノエル一式 |
クエスト『探索：倉庫地下施設』 
倉庫地下
フェンスの間を調べるとイベント発生。
ロボトル：一本橋ロボトル：VS野良メダロット
| 対戦相手 | 使用メダロット | 備考 |
|---|---|---|
| 野良メダロット | ゴーベンケー |
倉庫搬入路
左奥にある電源を入れよう。
入手：
メダロット：イエロータートル
ランダムエンカウント
| 対戦相手 | 使用メダロット | 備考 |
|---|---|---|
| 野良メダロット | G・O・デス | |
| 野良メダロット | ゴーフバレット | |
| 野良メダロット | バッドハッカー | |
| 野良メダロット | ベノムスコピー | カブトVer.限定 |
| 野良メダロット | マックスネイク | カブトVer.限定 |
| 野良メダロット | ディックスネイク | クワガタVer.限定 |
| 野良メダロット | ポイズンスコピー | クワガタVer.限定 |
鉱山口
入手：【カブトver.】ブルーコランダム
入手【クワガタver.】ピジョンブラッド
ムービーあのときのメダロットが見られる。
ロボトル：VSメタビー(カブトver.)、ロクショウ(クワガタver.)
(ちなみに負けてもストーリーは進む)
参考：ロボトル後、もう一度メタビー/ロクショウに近寄ると強制的に再戦になるので注意。何度でも再戦可。
：部室に戻ろう。
ランダムエンカウント
| 対戦相手 | 使用メダロット | 備考 |
|---|---|---|
| 野良メダロット | ウォーヘッドリィ | |
| 野良メダロット | ディスティニー | |
| 野良メダロット | テンガイキソー | |
| 野良メダロット | フレイムティサラ | |
| 野良メダロット | アステリオス | カブトVer.限定 |
| 野良メダロット | マーサイモラン | クワガタVer.限定 |
クエスト『探索：坑道入口』
山道
道なりに進むと、右側に石段がある。
坑道入口 (※期間限定エリア)
入手：かくとうリセット、なおすリセット、しかけるリセット
ロボトル：VS野良メダロット
ランダムエンカウント (坑道入口)
クエスト『探索：霧の樹海』
霧の樹海
ロボトル：VSボアブースター
| 対戦相手 | 使用メダロット | 備考 |
|---|---|---|
| 野良メダロット | ボアブースター×3 |
ランダムエンカウント
ロボトル大会編
クエスト『探索：倉庫地下施設』を進めて部室棟へ行くとイベントが発生。
部室棟
ロボトル（タイマン）：VSリュウセイ
| 対戦相手 | 使用メダロット | 備考 |
|---|---|---|
| リュウセイ | シィアンロン |
備考：ロボトル後「コンボ」システム解禁。負けてもイベントは進む
探検部へ行くとイベント発生。
探検部
仲間：ミオ、リョウマ離脱
：今日の部活は終わり。クエストを完了して帰ろう。
ボードを確認してクエスト完了。
教室から再開。
1-C教室
：部室でみんなと大会の相談をしよう。
教室を出るとイベント発生。
探検部
：大会に備えて最後の準備だ！
探検部のクニギクと話すとイベント発生。
仲間：ミオ、リョウマ、クニギク加入
リョウマと話すと大会を始められる。
クエスチョン：「準備OK」「もう少し･･･」
「準備OK」を選ぶとロボトル大会開始。クニギク離脱。
以下、3連戦となる。
ロボトル大会
ロボトル：VS武術部チーム
ロボトル：VSメダロット研究会チーム
ロボトル（連戦）：VSレスキュー部
入手：優勝トロフィー
CGロボトル大会優勝が見られる。
ロボトル大会終了。
4章へ。
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