CDリスト（アルバム）
【A01】天球の音楽
2006/12/6発売
シングルCD収録曲を中心に全14曲。初回生産分にはミニ写真集封入。
【A02a】マキノユイ。（初回限定盤）
2008/3/26発売
全12曲収録。PVとCM映像集のDVD付属。
【A02b】マキノユイ。（通常盤）
2008/3/26発売
アルバムタイトルの「。」は、発売が大学卒業と同時期であることから、一区切りの意味。
【A03a】Holography（初回限定盤）
2011/7/6発売
付属DVDには「お願いジュンブライト」のPVに加え、待望のコンサート映像3曲収録。
【A03b】Holography（通常盤）
2011/7/6発売
全13曲収録。収録ではピアノ演奏にも多数参加。
【A04a】Tabi*note（初回限定盤）
2015/10/7発売
付属DVDに「囁きは"Crescendo"」「きみの選ぶみち」のPVに加え、アルバムのジャケット撮影風景、マンスリーイベントのダイジェスト映像が収録されている。しかも由依さんのオーディオコメンタリー付き。
【A04b】Tabi*note（通常盤）
2015/10/7発売
全13曲収録。前作までとは雰囲気の異なる楽曲が多いのは、サウンドプロデューサーに矢野博康さんを迎えた影響が大きいという。
【A05a】WILL（初回限定盤）
2018/3/21発売
特典DVDには、アルバム内の「What A Beautiful World」収録風景と「Reset -A Cappella Version-」Special Movieが収録されている。
【A05b】WILL（通常盤）
2018/3/21発売
全7曲収録。"声"をフィーチャーしたという、由依さん初のミニアルバム。
既存曲4曲のうち「ウイークエンド・ランデヴー」以外はシングル版とバージョンが異なる。（アカペラversion, 弾き語りversion, EDM Remix）
【A06】UP!!!!
2019/3/20発売
由依さんにとって初の2枚組アルバム。セレクトアルバムという形式で、DISC1はライブ感重視、DISC2はピアノをがっつり弾いている曲、というコンセプト。
全22曲に新曲こそないものの、「Brand-new Sky」他8曲が新アレンジになっている。
【A07a】あなたとわたしを繋ぐもの（初回限定盤Ａ）
2022/10/5発売
7曲収録のミニアルバム。
特典Blu-ray Discには、アルバム収録曲のうち「Touch of Hope」「エスペーロ」のMusic Videoが収録されている。
【A07b】あなたとわたしを繋ぐもの（初回限定盤Ｂ）
2022/10/5発売
3形体でCDの7曲は同一だが、ジャケット写真は異なっている。ジャケット撮影の舞台は群馬県立ぐんま天文台。
特典は撮り下ろしフォト満載のスペシャルブックレット。
【A07c】あなたとわたしを繋ぐもの（通常盤）
2022/10/5発売
オンラインでないリリース記念イベントが久々に、2022/10/8にはカメイドクロック（東京都）、2022/10/10には阪急西宮ガーデンズ（兵庫県）で行われた。
新曲4曲を含む計7曲のミニアルバム。